安徽省疾病預(yù)防控制中心是在原安徽省衛(wèi)生防疫站(1953年4月建站）的基礎(chǔ)上，于2003年調(diào)整組建的全省綜合性疾病預(yù)防控制機(jī)構(gòu)，是隸屬于省衛(wèi)生健康委的公益性事業(yè)單位，同時(shí)掛牌省健康教育所和省公共衛(wèi)生研究院。

中心承擔(dān)政府疾病預(yù)防控制技術(shù)管理與服務(wù)職能，主要包括：傳染病、地方病、慢性非傳染性疾病等預(yù)防與控制、突發(fā)公共衛(wèi)生事件和災(zāi)害應(yīng)急處置、疫情及健康相關(guān)因素信息管理、健康危害因素監(jiān)測(cè)與干預(yù)、衛(wèi)生檢測(cè)與評(píng)價(jià)、健康教育與健康促進(jìn)、疾病預(yù)防控制技術(shù)管理與應(yīng)用研究指導(dǎo)等。

中心內(nèi)設(shè)23個(gè)科室，編制373人，截至2021年12月底，在職職工305人，離退休人員213人。各類專業(yè)技術(shù)人員278人，其中高級(jí)職稱80人，本科以上學(xué)歷占業(yè)務(wù)人員總數(shù)的85.6%。

中心擁有全省唯一的生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室，具有包括新冠病毒在內(nèi)的7種高致病性病原微生物實(shí)驗(yàn)資格。擁有微生物、理化檢驗(yàn)室，毒理學(xué)實(shí)驗(yàn)室，消毒潔凈實(shí)驗(yàn)室，艾滋病確認(rèn)實(shí)驗(yàn)室，碘缺乏病實(shí)驗(yàn)室，麻疹、脊灰實(shí)驗(yàn)室。中心各類實(shí)驗(yàn)室通過CNAS認(rèn)證認(rèn)可的檢驗(yàn)檢測(cè)項(xiàng)目1320個(gè)，通過CMA認(rèn)證認(rèn)可的檢驗(yàn)檢測(cè)項(xiàng)目1324個(gè)。

中心搭建有三大科研合作平臺(tái)，分別為省衛(wèi)生健康委與中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)依托中心共建的“聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室”，中心與安徽醫(yī)科大學(xué)、中科院物質(zhì)所共同成立的“重大傳染病綜合研究中心”以及與中科大附屬第一醫(yī)院（省立醫(yī)院）共建的“聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室”。中心還是“中國疾控中心中國現(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)培訓(xùn)項(xiàng)目安徽基地”“安徽醫(yī)科大學(xué)預(yù)防醫(yī)學(xué)專業(yè)教學(xué)基地”。傳染病病原分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、現(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)是安徽省“十三五”醫(yī)療衛(wèi)生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/重點(diǎn)?？疲滑F(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)、病原微生物分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室和艾滋病病毒分子與免疫學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室是安徽省“十四五”醫(yī)療衛(wèi)生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/重點(diǎn)專科。已建成國家突發(fā)急性傳染病防控隊(duì)（安徽）。

中心文明創(chuàng)建碩果累累，蟬聯(lián)四屆全國文明單位，獲得全國抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)集體、全國工人先鋒號(hào)、全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體、全國衛(wèi)生系統(tǒng)衛(wèi)生文化建設(shè)先進(jìn)單位、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體、安徽省文明單位、安徽省抗洪救災(zāi)先進(jìn)集體等各類榮譽(yù)70余項(xiàng)。中心涌現(xiàn)出全國抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)個(gè)人、全國抗擊新冠肺炎疫情三八紅旗手、全國抗疫最美家庭、安徽省勞模、安徽省優(yōu)秀援疆干部、安徽省雙百優(yōu)醫(yī)生、安徽省抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)個(gè)人、安徽好人、安徽省五一勞動(dòng)獎(jiǎng)?wù)聜€(gè)人、安徽省五四青年獎(jiǎng)?wù)聜€(gè)人、安徽省巾幗崗位標(biāo)兵、安徽省優(yōu)秀共青團(tuán)員、省直機(jī)關(guān)十大杰出青年、省直機(jī)關(guān)道德模范、合肥好人、合肥市崗位學(xué)雷鋒標(biāo)兵等先進(jìn)模范人物。